Da de bygget en ny og større kirke på Presteid ble den gamle flyttet til Karlsøy i 1885 og oppført der som kapellkirke. Kirken fikk da langplan fordi korsdelen var for dårlig. Det ble tilbygget kor, sakristi, våpenhus og galleri.
Oppføringen av kirken kom på den nette sum av kr. 5.600,- som ble betalt med overskuddet fra oppføringen av den nye Hamarøy kirke, innsamlede midler og bevilgninger fra herredsstyret. Kirken ble utvendig malt, og innvendig panelkledd før den ble innviet 21.juli i 1886 av biskop J. Skaar.
Kirken har vernestatus automatisk listeført (1650-1850). Arkitekt: S. Mathisen (1886)
Altertavlen.
Altertavlens opphav er ukjent. Altertavlen ble grundig analysert i 2006 og konservert etter anbefaling fra konservator og riksantikvaren. Det foreligger en omfattende rapport om tavlens historie.
Altertavlen viser Jesus på korset og de to røverne på hver side. (matt.27.44) Nedenfor korset sitter det tre kvinner, Kanskje Maria-mor til Sebedeussønnene, Maria- mor til Jakob og Josef, og Maria Magdalena. (Matt 27.56)
Tavlen har 4 forskjellige malingslag. Det første er fra tidlig på 1700-tallet, det andre fra midten av 1700-tallet. Disse lagene er fargerike og detaljerte. Det tredje laget er fra 1885 og er utført i hvitt, lyseblått og uekte gullforgylling av H.Aas fra Steinkjer. Denne overmalingen er så igjen oppfrisket med hvitt og ekte gullforgylling på første del av 1900-tallet
I feltet nedenfor er det et maleri av det siste måltid, nattverden. Denne delen er ikke overmalt gjennom historien.Nedenfor der igjen er følgende tekst malt:
«Han som æder mit Kjød og drikker mit Blod har et evigt Liv og Jeg skal opreise ham paa den yderste Dag. Job 6.54»
Inventaret
Nesten alt av brukbart inventar fulgte med fra Presteid i 1884. Kirka har ifølge gamle papirer 130 sitteplasser.
Orgelet var en gave fra handelsmann J. Pedersen Karlsø, bygget av orgelbygger Isaksen i Levanger.
Sommeren 1964 gjennomgikk kirken en omfattende restaurering og ble malt i lyse farger. Kirken er godt vedlikeholdt, mye takket Karlsøy kirkeforening som har samlet inn penger i mange år.
Kirka ligger vakkert til på Finnøy med utsikt over fjorden. Karlsøy kirkegård ligger rett nedenfor og har plass til i underkant av 300 gravsteder. Det finnes også en moderne bygning ved siden av som inneholder WC, redskapsbu, bårerom/kjøle og nødvendige fasiliteter for kirkegårdsarbeidere.
Det er forordnet 7 gudstjenester pr år i Sagfjord kirke. En av disse er på julaften, da denne vakre gamle kirken kommer til sin rett med levende lys i alle lysekroner.